Un peu plus d’un bachelier S sur deux (54,8 % en 2010-2011) s’inscrit en fac (hors IUT, institut universitaire de technologie). S’ils réussissent bien dans la plupart des filières, sans surprise, ils sont les plus nombreux dans les domaines des sciences de la vie et de la santé (notamment en chimie, en biologie humaine, en biochimie ou en physique biomédicale) et des sciences et technologies (mentions ma­thé­matiques, applications des mathématiques ou informatique, notamment).

Surtout,  les bacheliers S se dirigeant vers l'université optent pour la première année des études de santé (PAES), qui s’achève par 4 concours (médecine, pharmacie, chirurgie dentaire et sage-femme). Ceux qui échouent ont la possibilité de tenter les concours des écoles paramédicales (infirmier, orthophoniste, orthoptiste...) ou de se réorienter vers l'université, par exemple en licence sciences de la vie. Après 2 ou 3 années à la fac, il est possible de bifurquer vers une licence professionnelle ou vers les concours d’admission parallèle en écoles d’ingénieurs.

Outre médecine et les licences scientifiques, on retrouve enfin les S dans toutes les filières de l'université. Ils se répartissent en ltes filières langues (parmi les nouveaux inscrits, 11 % de bacheliers S à la rentrée 2010-2011), lettres et arts (14 %), sciences humaines et sociales (14 %), droit et sciences politiques (17 %), économie et AES (25 %) et surtout STAPS (39 %).